疾病的治疗方法多种多样，根据是否需要手术治疗，基本上都可以分为“外科病”和“内科病”：以手术为主要治疗手段的疾病称为外科病，由外科负责治疗；以药物为主要治疗手段的称为内科病，由内科负责治疗。例如，同样都是“胃溃疡”这种疾病，多数患者用药物治疗就可以治好，属于内科病，主要在消化内科治疗。但有的患者因为溃疡严重，甚至出现胃穿孔，需要手术治疗就属于外科病，需要在消化外科（即普外科或称基本外科）治疗；再比如脑出血，少量脑出血，只需要采用止血、降压等药物治疗方法，属于神经内科。大量出血，颅内压显著升高，出现脑组织显著移位，需要手术清除血肿，则属于神经外科；同样的，对于癫痫病，主要采用药物治疗癫痫的，主要属于癫痫内科（在多数医院隶属于神经内科），如果药物治疗效果不佳，需要手术治疗的，则属于癫痫外科（一般隶属于神经外科）。
到大医院里去看病，是不是觉得科室划分比较杂乱，不知道该挂哪个科的号？那么医院里的科室是怎么划分的呢？
医院科室划分之所以比较复杂甚至混乱，是因为采用了不同的分类系统，而且不同的分类系统同时存在，甚至相互交叉。
根据以药物治疗为主还是手术治疗为主，几乎所有临床科室都可以划分为内科和外科两大系统。人类对疾病治疗的基本手段就是药物治疗和手术治疗。内科就是以药物为主要治疗手段的科室，外科就是以手术为主要治疗手段的科室。需要强调的是，这里的内外并不是指身体的内部和外部，内脏受伤严重，需要手术治疗的也属于外科病；身体外部（体表）的疾病，只要不需要手术治疗，也不属于外科。关于“内科”和“外科”名词的由来众说不一，但其今天所代表的含义基本是明确的。
根据身体的不同器官和系统来分，又分出不同的内科和外科分支。如主要以腹部消化系统器官，包括肝、胆、胰、脾和胃肠道为治疗对象的内科称为消化内科，相应的外科则称为消化外科（即所谓的普外科或者基本外科，通常把脾脏纳入基本外科）。以泌尿系统器官（肾脏、输尿管、膀胱、尿道）为主的外科，称为泌尿外科，以泌尿系为主的内科称为泌尿内科（通常称为肾内科）；以肺、气管和胸壁为治疗对象外科称为胸外科，以肺和气管为治理对象的内科称为呼吸内科；以心脏为主的外科为心外科，以心脏为主的内科称为心内科；以中枢神经系统为主的外科称为神经外科，以中枢神经系统为主的内科为神经内科（或称神经科）；以脊柱和四肢骨骼为主的外科为骨科（即骨外科）。
此外根据身体不同部位和器官系统分类，还可以分出耳鼻喉科、眼科、口腔科、乳腺科、妇产科、男性科、皮肤科、内分泌科、免疫科等。其中每个科也都可以分成内、外科，例如口腔内科和口腔外科等。其他如耳鼻喉科、眼科等也都是内外科治疗方法并用的。内分泌科和免疫科主要以内科治疗为主，但当出现内分泌肿瘤，如垂体腺瘤、肾上腺肿瘤、胰岛细胞瘤时就会分到相应的外科治疗。如，垂体腺瘤归神经外科，肾上腺瘤归泌尿外科，胰岛细胞瘤归基本外科。而有些医院把耳鼻咽喉及甲状腺疾病等归入头颈外科。
根据年龄划分，可以分成儿科和老年科等。儿科又可以分成小儿内科、小儿外科。进一步地可以分成小儿神经外科、小儿神经内科等等。
根据人类再生产的特殊性和常见性，分成妇产科。妇产科又进一步分出产科和妇科，前者主要负责产前检查和分娩服务，属于正常的生理过程，一般孕妇都可以正常分娩婴儿，可以认为是内科产科，如果无法正常分娩，需要剖宫产，则属于外科产科的范畴；而妇科则主要针对妇科疾病，包括肿瘤等，治疗方法也可以分为药物治疗为主或手术为主。
根据疾病的性质分科。如感染科，主要针对治疗比较困难的感染性疾病；肿瘤科，主要针对肿瘤；精神病科，针对精神疾患。运动医学科，针对运动损伤和保健等；
上述主要是根据西医分类，根据祖国中医学建立了中医科。其中也可以分出中医内科和中医外科。再进一步的分科和西医类似。
根据治疗方法，除了药物治疗和手术治疗之外，还有放射治疗、核医学科、物理治疗、心理治疗等方法。也因此衍生出了放疗科、康复科、心理医学科等。
不同科室分类的复杂，甚至有些混乱，体现出了医学的复杂性。对于科室的划分，每个医院也会有所不同。不同的科室之间，也有很多交叉，无法截然分开。例如，同样是甲状腺功能亢进，内分泌科可以用药物治疗，基本外科可以行手术治疗，核医学科可以给与碘131内放射治疗。三种治疗方法孰优孰劣，有时不易确定。通过综合评估，才能够可以找到对患者最为合适的治疗方法，将来或许可以把这三个科的大夫整合为一个甲状腺科。
